Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rnf40Q3U319 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf40Q3U319 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms