Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms