Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hace1Q3U0D9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms