Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmtk2Q3TYD6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmtk2Q3TYD6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms