Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms