Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms