Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Treml4Q3LRV9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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