Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Shroom4Q1W617 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
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Shroom4Q1W617 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shroom4Q1W617 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms