Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samd11Q1RNF8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd11Q1RNF8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms