Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim71Q1PSW8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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