Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Fam171bQ14CH0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Fam171bQ14CH0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Fam171bQ14CH0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam171bQ14CH0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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