Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam47cQ14BE7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms