Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntnap5bQ0V8T8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntnap5bQ0V8T8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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