Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms