Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NeblQ0II04 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms