Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncf1Q09014 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms