Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cass4Q08EC4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms