Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tff1Q08423 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms