Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CACNB2Q08289 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNB2Q08289 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms