Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cnn2Q08093 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cnn2Q08093 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms