Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnn1Q08091 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnn1Q08091 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms