Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rcn1Q05186 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rcn1Q05186 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms