Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Apoc2Q05020 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apoc2Q05020 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms