Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox13Q04891 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox13Q04891 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms