Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms