Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpd1Q04519 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smpd1Q04519 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms