Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItkQ03526 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms