Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfiaQ02780 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NfiaQ02780 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms