Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Muc1Q02496 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms