Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms