Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VcpQ01853 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms