Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1cQ01815 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms