Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbp1Q01514 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms