Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grin2cQ01098 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms