Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F8a1Q00558 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms