Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pax8Q00288 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms