Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AlkP97793 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AlkP97793 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AlkP97793 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AlkP97793 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AlkP97793 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms