Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cry1P97784 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms