Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms