Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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