Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gbx1P82976 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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