Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irx1P81068 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irx1P81068 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irx1P81068 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms