Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms