Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Otx2P80206 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Otx2P80206 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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