Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad1P70340 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms