Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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