Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb13P70321 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxb13P70321 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Hoxb13P70321 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hoxb13P70321 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Hoxb13P70321 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb13P70321 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms