Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrig1P70193 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrig1P70193 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms