Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps17P63276 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms