Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rps3P62908 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms